存货清查的计算步骤如下：

确定实际盘存数量与账面数量差异

通过定期或不定期的存货盘点来实现。

评估存货的可变现净值

考虑存货的市场价格、销售前景等因素。

计算损失金额

存货短缺或毁损的损失金额 = 实际盘存数量与账面数量差异 × 存货的可变现净值。

扣除可能回收的价值

如残值或保险赔偿等。

会计分录处理

盘亏或毁损（非自然灾害等非常原因造成）：

批准前：借：待处理财产损溢 贷：原材料/库存商品等

批准后：借：管理费用/其他应收款（保险公司或责任人赔偿） 贷：待处理财产损溢

盘盈（非计量收发差错和管理不善等原因造成）：

批准前：借：原材料等 贷：待处理财产损溢

批准后：借：待处理财产损溢 贷：管理费用

期末处理

将“待处理财产损溢”科目期末处理后应无余额。

请根据具体情况选择合适的核算方法，并注意遵循相关会计原则和规定。