如果您遇到证书被公司扣押或盗用的情况，您可以采取以下步骤来追讨或处理：

证书被公司扣押

协商：

首先尝试与用人单位协商，了解具体情况，看是否能够通过友好方式解决问题。

投诉：

如果协商不成，您可以向当地劳动行政部门投诉，请求其介入处理。

劳动仲裁：

如果投诉无果，您可以向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁。

法律途径：

如果上述方法都不能解决问题，您可以向人民法院提起民事诉讼，要求单位归还证书，并承担相应的法律责任。

证书遗失或被盗用

报告丢失：

向发证机关报告证书丢失，可能需要填写丢失报告表格并提供身份证明文件。

登报声明：

在报纸上刊登丢失声明，防止他人冒用您的证书。

补办申请：

向发证机关提交补办申请，提供必要的个人信息和证件复印件。

支付费用：

根据发证机关的规定支付补办费用。

等待新证书：

完成补办流程后，等待新的证书制作并领取。

法律依据

根据《劳动合同法》，用人单位不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件。如果公司违反了这一规定，劳动行政部门会责令其限期退还，并可能依法进行处罚。

额外建议

在处理过程中，请确保保存好所有相关的证据材料，如劳动合同、工资卡、个人数据等，以支持您的申诉。

如果需要法律帮助，建议咨询专业的法律顾问以获得具体的指导和建议。

请根据您的具体情况选择合适的步骤来处理证书问题。