公司申请停工需要遵循以下步骤：

提出申请

纳税人在营业执照核准的经营期内，向税务登记管理环节提出申请，领取并填写《停业登记表》。

受理审核

税务登记管理环节受理纳税人填写完毕的表格及有关资料，审阅填报的表格及有关资料是否符合要求。

停业处理

确认申请停业的纳税人税款已结清、发票已缴销，封存其税务登记证件，报领导批准后，核准其停业申请，制作《核准停业通知书》。

提交必要材料

申请停工留薪期确认通常需要向所在单位提出申请，并提供必要的证明材料，如医疗证明或其他相关文件。

等待审核

单位将根据相关法律规定和单位内部规章制度审核申请，并作出是否批准的决定。

确认停工留薪期

一旦申请被批准，与单位协商并确认停工留薪的具体期限。

遵守税收规定

如果公司因自然灾害、事故灾难、公共卫生事件、社会安全事件等原因造成经营困难，可以自主决定在一定时期内歇业，但需遵守税收规定，并及时向税务机关申报和补交税款。

恢复经营

如果公司想恢复生产，需要提前向税务机关提出复业申请，填写好复业申请登记表后，办理复业登记，税务部门同意后，领回税务登记证、发票领购簿及其之前交给税务部门的发票。

法律后果

公司歇业不等同于公司注销，此时公司的法人资格仍然存在。歇业后未办理注销登记，也无清算组织负责清理债权债务的，公司和清算主体为共同诉讼主体。

报备与恢复营业

企业处于歇业状态可以向工商局报备一份歇业说明书，如果已经处以歇业状态的公司想要恢复经营的需要向工商局提前进行报备申请恢复营业，得到许可之后方能正常营业。

在申请停工时，公司需要提供充分的证明材料，如财务报表、纳税申报表、第三方审计报告、股东会或董事会决议、客户或供应商的往来函件等，以证明其生产经营困难。同时，公司需遵守相关税收规定，确保在歇业期间合法合规。