当村长拒绝签字时，可以采取以下措施来处理：

沟通协商

首先尝试与村长进行沟通，了解其拒绝签字的具体原因和顾虑，看是否能够通过协商解决问题。

上级反映

如果沟通无果，可以向村委会或乡镇政府的相关部门提交书面材料，说明情况，请求他们介入协调。

法律途径

如果村长的行为存在违法违规情况，或者侵犯了您的合法权益，可以依据《行政诉讼法》将此事告到人民法院，要求法院判令村长履行签字职责或纠正其不当行为。

收集证据

在整个过程中，确保收集和准备好所有相关的证据材料，如土地使用证、建房规划许可证等，以便在需要时能够提供充分的证据支持自己的诉求。

寻求专业帮助

如果自己处理起来有困难，可以咨询专业律师，了解自己的权益，并依法进行维权。

建议在选择处理方式时，先尝试通过沟通和协商解决问题，如果这无法奏效，再考虑采取法律手段。同时，确保在整个过程中保持冷静和理性，避免情绪化的行为影响问题的解决。