楼顶水泥起皮的处理步骤如下：

1. 清理：首先将起皮的部分铲掉，并清理掉所有杂质和灰尘。

2. 密封固化：在清理后的水泥面上均匀涂刷密封固化剂，以增强表面的耐用性。

3. 修补：将修补剂和水泥砂浆调配好，并搅拌至适宜的稠度，然后填补在待修补的位置。

4. 压实抹平：修补完成后，使用工具将修补处压实并抹平，确保表面平整无缺陷。

5. 防水处理：为了保险起见，建议在做完修补后，在水泥面上再做一次防水处理，以防漏水。

请注意，如果起皮问题严重，可能需要将原有的水泥层铲除，重新铺设新的水泥砂浆。